Uno de los principales problemas que yo he visto en los años que llevo metido en esto (aparte de los que comenta Luis), es que no se distingue entre dos perfiles que son muy distintos a día de hoy, el IT Manager y el SysAdmin.
El IT Manager debe depender (o ser el responsable final en empresas tecnológicas) de la persona responsable de todos los temas de infraestructura, del mismo tío que elige la oficina o los coches de dirección. Su función es la continuidad de la operativa y el adecuamiento de los costes de la misma.
El Sysadmin, a día de hoy, tiene que ser un miembro más del equipo de desarrollo. Debe depender de un JP o un Director de Proyectos y su misión es la continuidad de negocio, aparte de las que comenta Luis en su post.